鐵皮石斛在中藥配伍禁忌“十八反、十九畏”中惡寒水石、巴豆、畏僵蠶、雷丸。本品性屬清潤，清中有補，補中有清，故最宜于虛而有熱者，凡虛而無火或實熱證、舌苔厚膩、腹脹者均忌服。本品能斂邪氣，使邪不外達，故溫熱病不宜早用，如感冒初起，邪重而正不虛，此時使用易造成“閉門留寇”；本品又能助濕邪，若濕溫尚未化燥者忌服。

鐵皮石斛的常用量干品為6～12g，鮮品15～30g。鐵皮石斛的用法宜人煎劑、熬膏或入丸散，入煎劑復方宜先煎，一般宜先煎30min以上，單用需久煎。《中藥大辭典》中記載：此物最耐久煮，一味濃煮，始有效力，若雜人群藥中僅煮沸30~40min，其味尚未出也，現代研究也證明，石斛堿等內酯類生物堿只有經過先煎或久煎的水解產物才起治療作用。